Seminario: "Entre Datos, Sistemas Complejos y Biología."
Presenta: Dr. Edgardo Galán Vásquez
Fecha: 28 octubre 2024, 15:00 hrs.
Ubicación: Aula Magna (piso 6), UAM Cuajimalpa
Transmisión en vivo por YouTube: DCNI UAM Cuajimalpa
"Entre Datos, Sistemas Complejos y Biología."
En la actualidad, hemos pasado de la escasez a la abundancia en cuanto a conjuntos de datos disponibles para la experimentación en diversas áreas de la ciencia. Esto ha permitido explorar diferentes fuentes de información de manera masiva y transfórmala en conocimiento útil mediante enfoques de ciencia de datos y sistemas complejos.
Particularmente, nos enfocamos en el área biológica, en la donde el surgimiento de nuevas tecnologías de alto rendimiento ha generado grandes volúmenes de datos. Esto ha requerido el desarrollo de nuevas estrategias integrales que combinan la computación, las matemáticas y la biología para identificar propiedades emergentes de los organismos.
En nuestro grupo, trabajamos con aproximaciones de Minería de datos, redes complejas y algoritmos de aprendizaje automático para identificar o clasificar conjuntos de elementos importantes a partir de datos masivos de expresión genética, genómica e información depositada en bases de datos.
Esto, nos ha permitido identificar genes importantes relacionados a muerte celular, factores de virulencia, cáncer de mama, entre otros. Además, hemos desarrollado algoritmos para identificar patrones de expresión y clasificar sitios de unión a factores de transcripción. Este enfoque interdisciplinario nos está ayudando a transformar grandes volúmenes de datos en descubrimientos biológicos significativos.
El Dr. Edgardo Galán Vásquez es Ingeniero Químico con Especialidad en Alimentos,
egresado del Instituto Tecnológico de Oaxaca (2003-2009). Estudio la Maestría y el Doctorado en
Ciencias en la Especialidad de Biotecnología de Plantas en el Centro de Investigación y de Estudios
Avanzados del Instituto Politécnico Nacional - Unidad Irapuato México. Donde, estudio la topología y
evolución de las redes de regulación transcripcional de bacterias.
Posteriormente, realizó una primera estancia postdoctoral en el Instituto de Física de la Universidad
Autónoma de San Luis Potosí en el laboratorio del Dr. Edgardo Ugalde, estudiando la dinámica y
criticalidad de las redes de regulación genética. Además, realizó una segunda estancia posdoctoral en
el Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas de la UNAM con el Dr. Ernesto
Pérez Rueda, donde realizó el procesamiento de datos por medio minería de datos y estudiando redes de
co-expresión genética.
En 2019, se incorporó como Investigador Asociado C de tiempo completo al Departamento de Ingeniería de
Sistemas Computacionales y Automatización del Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en
Sistemas de la Universidad Nacional Autónoma de México.
Sus líneas de investigación se centran en el área de las Redes complejas, Minería de datos Biológicos y
la Ciencia de datos con enfoque a la Bioinformática y Biología de sistemas. Con el objetivo de comprender la
expresión genética de diferentes organismos. En este sentido, estudia la reconstrucción y análisis de
redes de regulación genética y de co-expresión genética, mediante el uso de estrategias de aprendizaje
automático. Así como, el estudio topológico y dinámico de diferentes redes complejas.
El Dr. Galán ha tenido una participación en la docencia en la UNAM, donde ha impartido cursos de
Bioinformática, Biología de sistemas, Minería de datos y Datos masivos. Además, desde el 2017
pertenece al Sistema Nacional de Investigadores en el Nivel 1. Es autor de 20 publicaciones
internacionales arbitradas e indexadas y de dos capítulos de libros.