“Estudios Moleculares de Sistemas Biológicos” (clave UAM-C-CA-15)

(Cuerpo Académico en Consolidación)

Integrantes:

1. Dr. Arturo Rojo Domínguez
2. Dra. Mariana Peimbert Torres
3. Dr. Hugo Nájera Peña
4. Dr. Edgar Vázquez Contreras

Líneas de generación o aplicación innovadora del conocimiento:

1. Estructura y Reconocimiento Molecular en Proteínas (ERMP). En esta línea se incluyen trabajos experimentales dedicados al conocimiento de la estabilidad estructural de proteínas, desde el punto de vista de la termodinámica de equilibrio hasta los procesos cinéticos que la llevan a ese equilibrio. También está incluido el estudio del mecanismo de plegamiento y el proceso evolutivo de las proteínas; así como conocer detalles de las interacciones con otras proteínas y diferentes moléculas como ligandos naturales o artificiales, cosolutos y solventes. Una de las aplicaciones prácticas de esta línea es el diseño racional de modificaciones en la secuencia de aminoácidos que confieran a la cadena polipeptídica estabilidad a condiciones extremas de temperatura, fuerza iónica, acidez, entre otras.
2. Síntesis y Caracterización de Compuestos Bioactivos (SCCB). Esta línea de investigación tiene como objetivo estudiar desde diferentes metodologías experimentales las propiedades moleculares que le confieren a las substancias su actividad biológica. Esta actividad debe entenderse de la forma más amplia en donde se incluye su función como sustrato, inhibidor, cofactor o fármaco potencial, entre otras. Los estudios que se desarrollan bajo esta línea incluyen el uso de métodos espectroscópicos para caracterizar compuestos, la síntesis de nuevas moléculas o derivados de compuestos líder, estudios de asociación de las moléculas bioactivas con sus receptores, sobre líneas celulares, tejidos u organismos biológicos. Las metodologías antes mencionadas están orientadas a identificar los efectos de compuestos novedosos en la sobrevivencia, muerte y diferenciación de sistemas biológicos, así como los mecanismos moleculares o vías de señalización que desencadenan estos efectos.
3. Análisis computacional de biomoléculas (ACB). Los trabajos que se incluyen en esta línea de investigación comprenden el uso de equipos de cómputo, servidores de Internet, bases de datos y paquetería de cómputo para resolver problemas de interés biológico a nivel molecular. Implica el uso de herramientas bioinformáticas y de bioquímica computacional para comprender y analizar secuencias de aminoácidos, estructuras tridimensionales y las interacciones intermoleculares de compuestos químicos de relevancia biológica. También incluye la utilización de simulaciones de dinámica molecular y anclaje de sustratos, estudios de reactividad a través de cálculos de estructura electrónica, relaciones cuantitativas entre la estructura y la actividad (QSAR), diseño racional de ligandos y fármacos, además de la articulación de los resultados con las otras líneas de investigación.

Objetivos comunes de las integrantes del Cuerpo Académico

1. Formación de recursos humanos a nivel de licenciatura y posgrado.
2. Realización de eventos académicos especializados.
3. Generar conocimiento nuevo a partir de proyectos de investigación en conjunto sobre Estructura y Reconocimiento Molecular en Proteínas, Análisis computacional de biomoléculas y Síntesis y Caracterización de Compuestos Bioactivos.
4. Presentación de trabajos en congresos especializados nacionales e internacionales.
5. Publicación de resultados en revistas internacionales indizadas.

Programas educativos en los que participan las integrantes del Cuerpo Académico

1. Licenciatura en Biología molecular
2. Licenciatura en Ingeniería biológica
3. Licenciatura en Matemáticas aplicadas
4. Doctorado en Ciencias Biológicas y de la Salud
5. Maestría en Ciencias Naturales e Ingeniería
6. Doctorado en Ciencias Naturales e Ingeniería