Seminario: "Perspectiva de redes ecológicas en la microbiota intestinal y la progresión de diabetes tipo 2: taxones clave en una cohorte mexicana"
Presenta: Dr. Diego Armando Esquivel Hernández
Fecha: Octubre 16 2023, 15:00 hrs.
Ubicación: Aula Magna (piso 6), UAM Cuajimalpa
Transmisión: Vía YouTube
La microbiota intestinal (GM) humana es un sistema dinámico cuyas interacciones ecológicas entre los miembros de la comunidad afectan el metabolismo del huésped. El entendimiento de los principios que rigen la comunicación bidireccional entre la microbiota intestinal y su huésped es una herramienta valiosa para descubrir cómo la ecología microbiana influye en las variables clínicas del hospedero. Con el fin de abordar esta pregunta, se utilizó la herramienta SparCC para inferir redes de asociación en datos de amplicones del gen 16S rRNA del GM de una cohorte de pacientes mexicanos con diabetes tipo 2 (T2D) en diferentes etapas: NG (normoglucemia), IFG (glucosa alterada en ayunas), IGT (tolerancia a la glucosa alterada), IFG + IGT (glucosa alterada en ayunas más tolerancia a la glucosa alterada), T2D y T2D tratados (T2D con un tratamiento continuo de 5 años).
En cuanto a los resultados, pudimos explorar la topología de las redes de las diferentes etapas de la T2D, observamos que, a medida que avanza la enfermedad, las redes pierden la asociación entre bacterias. Esto sugiere que la comunidad microbiana se vuelve muy sensible a las perturbaciones en personas con diabetes tipo 2. Con el propósito de identificar aquellos géneros que guían esta transición, computacionalmente encontramos taxones clave (nodos conductores) y géneros centrales para una cohorte mexicana de diabetes tipo 2. En conjunto, se propone un conjunto de géneros bacterianos que impulsan el progreso de la diabetes tipo 2 en una cohorte mexicana, entre ellos el grupo Ruminococcaceae NK4A214, Ruminococcaceae UCG- 010, Ruminococcaceae UCG-002, Ruminococcaceae UCG-005, Alistipes, Anaerostipes y Terrisporobacter.
Finalmente, a partir del enfoque de redes de asociación este estudio sugiere un conjunto de géneros que pueden servir como potenciales biomarcadores para distinguir el distinto grado de avance en la diabetes tipo 2 para una cohorte mexicana de pacientes. Más allá de limitar nuestra conclusión a una población, presentamos un proceso computacional para vincular redes ecológicas y etapas clínicas en la diabetes tipo 2, lo cual representa un importante avance en el campo de la medicina de precisión.
Dr. Diego Armando Esquivel Hernández
El Doctor Esquivel se graduó en Ingeniería en Biotecnología (2011) y Doctorado en Biotecnología (2016), ambos grados en el Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey, Campus Monterrey. Durante su posgrado empleó cianobacterias y levaduras altamente productoras de etanol, como modelos de estudio de biorefinerías enfocadas en la captura de dióxido de carbono y su implementación en procesos de química verde para la obtención de bioproductos.
Durante su formación científica ha realizado distintas estancias de investigación en instituciones de alto prestigio en el ámbito nacional e internacional como son: Universidad de Nápoles Federico II, Instituto de Biotecnología UNAM, Instituto de Ecología UNAM e Instituto Nacional de Medicina Genómica.
Después de una serie de estancias posdoctorales, en Julio 2022 el Dr. Esquivel se incorporó a la UAM Cuajimalpa como Profesor Visitante Titular B en el Departamento de Procesos y Tecnología y como miembro del cuerpo académico de Biotecnología Celular y Tisular.
Sus áreas de interes consisten en el Desarrollo de aplicaciones biotecnológicas basadas en microbiomas, Desarrollo de estrategias de medicina personalizada y microbioma intestinal, Ecología microbiana y evolución, Bioinformática, Biología de sistemas e Ingeniería metabólica.
En septiembre 2023, fue galardonado con el Premio Carlos Casas Campillo, con el fin de reconocer y estimular a destacados jóvenes biotecnólogos por su labor realizada en México, dicho reconocimiento se entrega de manera bianual durante el Congreso de Biotecnología y Bioingeniería organizado por la Sociedad Mexicana de Biotecnología y Bioingeniería SMBB.