División de Ciencias Naturales e Ingeniería - UAM Cuajimalpa

DIVISIÓN DE CIENCIAS NATURALES E INGENIERÍA



Dr. Arturo Rojo DomínguezDEPARTAMENTO DE CIENCIAS NATURALES

Resumen Curricular

Formación académica

  • Licenciatura en Química. Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa, 1986
  • Maestría en Química (Biofisicoquímica) UAM-I, 1988
  • Doctorado en Ciencias (Biofisicoquímica) UAM-I, 1992
  • Estancia de Investigación. Departamento de Química. Universidad de Cambridge, Inglaterra. 2002
  • Estancias de Investigación. Instituto Pasteur, París. 2012 y 2013
  • Miembro del S.N.I. nivel III. Área I, Físico Matemáticas y Ciencias de la Tierra. Periodo 2019-2028

 

Cursos que imparte

En el primer trimestre ha impartido en diversas ocasiones la UEA Introducción al Pensamiento Matemático, reflejo de su interés en el desarrollo de habilidades cognitivas. Por su formación y experiencia en investigaciòn ha impartido también los cursos de Química, Bioinformática, Laboratorio de Bioquímica y Nanociencias. Dentro de las UEA optativas ofrece regularmente el curso de Comunicación de la Ciencia y Temas Selectos de Bioquímica y de Biofisicoquímica, entre otras. Además imparte diversos cursos de posgrado.

 

Experiencia laboral y académica

Se incorporó a la Unidad Cuajimalpa de la Universidad Autónoma Metropolitana en enero de 2006 para fundar el Departamento de Ciencias Naturales. Posteriormente fue designado Rector de esa Unidad durante el periodo 2009-2013. Anteriormente laboró como personal académico de la Unidad Iztapalapa de la UAM en el período 1984-2005, en el área de Biofisicoquímica del Departamento de Química, donde fungió como Jefe del Area de Investigación en Biofísicoquimica en los períodos 1992-1995 y 1996-2002.

Su investigación inicial fue experimental en purificación y caracterización de proteínas, estudios de desplegamiento, y sobre la relación estructura función. Posteriormente fue uno de los primeros investigadores en nuestro país en incorporar el análisis y simulación molecular a estudios sobre la estructura de proteínas. Actualmente trabaja en temas relacionados con la estructura de biosistemas, la energética y mecanismos de plegamiento, la simulación molecular y el diseño de fármacos para el combate de diferentes enfermedades.

Cuenta con más de 70 publicaciones internacionales en revistas como: Biochemical and Biophysical Research Communications, Archives of Biochemistry and Biophysics, Journal of the American Chemical Society, Comparative Biochemistry and Physiology, Journal of Physical Chemistry B, Phytochemistry y Protein Science. Sus trabajos han sido citados en más de 1,600 ocasiones. 

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Distinciones

Rector de la Unidad Cuajimalpa de la UAM durante el periodo 2009-2013.

Premio “Jorge Rosenkranz” Convocatoria 2008 – 25 Aniversario. Al mejor trabajo de investigación médica realizado en México en el área de Ciencia Básica a investigadores consolidados. Otorgado por el Grupo Roche Syntex de México. Octubre 2008.

Asesor de la Mejor Tesis de Posgrado de Medicina en el Instituto Politécnico Nacional, 2007.

Finalista en el XXVIII Premio Nacional en Ciencia y Tecnología de Alimentos 2004. Categoría Profesional en Ciencia de los Alimentos. Industria Mexicana Coca-Cola y CONACYT.

Reconocimiento al Perfil Deseable PROMEP desde 2003 a la fecha, otorgado por la Subsecretaría de Educación Superior e Investigación Científica, Secretaría de Educación Pública.

En 1998 obtuvo el Premio a la Docencia 1998. División de Ciencias Básicas e Ingeniería. UAM-Iztapalapa y en 1986 obtuvo el Diploma a la Investigación 1986 por un proyecto realizado durante la Licenciatura en Química, UAM-I.

Jefe Fundador del Departamento de Ciencias Naturales. UAM, Unidad Cuajimalpa, a partir del 23 de enero de 2006.

Miembro fundador de la Rama de Fisicoquímica, Estructura y Diseño de Proteínas, de la Sociedad Mexicana de Bioquímica. 19 de octubre de 2005.

Jefe Fundador del Área de Biofisicoquímica. Unidad Iztapalapa de la UAM. Periodos 1992-1995 y 1996-2002.

Área de interés/experiencia en investigación

Áreas de interés y de investigación:

  • Biomedicina, diseño de fármacos y bioinformática  
  • Estudios de estabilidad y estructura de biomoléculas
  • Análisis computacional de biomoléculas
  • Reconocimiento proteína-ligando y acoplamiento simulado o docking
  • Inhibidores de enzimas
  • Proteasas sulfhidrílicas
  • Espectroscopía y calorimetría de proteínas

Publicaciones en Revistas

Publicaciones relevantes recientes

 

Leukocyte Nuclear Morphology Alterations in Dilated Cardiomyopathy Caused by a Lamin AC Truncating Mutation (LMNA/Ser431*) Are Modified by the Presence of a LAP2 Missense Polymorphism (TMPO/Arg690Cys)

Antonia González-Garrido, Sandra Rosas-Madrigal, Arturo Rojo-Domínguez, Jaime Arellanes-Robledo, Enrique López-Mora, Alessandra Carnevale, Leticia Arregui, Rigoberto Rosendo-Gutiérrez, Sandra Romero-Hidalgo and María Teresa Villarreal-Molina. International Journal of Molecular Sciences. (2022) 23(21):13626. https://doi.org/10.3390/ijms232113626

Triosephosphate isomerase as a therapeutic target against trichomoniasis
Claudia Guadalupe Benítez-Cardoza, Luis G. Brieba, Rossana Arroyo, Arturo Rojo-Domínguez, José L. Vique-Sánchez. Molecular and biochemical parasitology. (2021) 246:111413. https://doi.org/10.1016/j.molbiopara.2021.111413

Hen lysozyme fibrillogenesis, molten globule intermediate and effect of copper salts
Ricardo Cerón, Mariana Peimbert, Arturo Rojo-Domínguez, Hugo Nájera. (2021) Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 1–12. Advance online publication. https://doi.org/10.1080/07391102.2021.2006090

On the conformational search of a βCD dendritic derivative: NMR and theoretical calculations working together reveal a donut-like amphiphilic structure
Luis José López-Méndez, Yareli Rojas-Aguirre, Hugo Vázquez-Lima, Julia Cassani, Raúl G. Enríquez, Arturo Rojo-Domínguez, Patricia Guadarrama. Journal of Molecular Structure. (2020) 1204:127535
https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2019.127535

Enthalpically-driven ligand recognition and cavity solvation of bovine odorant binding protein
Homero Gómez-Velasco, Arturo Rojo-Domínguez, Enrique García-Hernández. Biophys Chem. (2020) 257:106315. https://doi.org/10.1016/j.bpc.2019.106315

Laccases: structure, function, and potential application in water bioremediation
Leticia Arregui, Marcela Ayala, Ximena Gómez-Gil, Guadalupe Gutiérrez-Soto, Carlos Eduardo Hernández-Luna, Mayra Herrera de Los Santos, Laura Levin, Arturo Rojo-Domínguez, Daniel Romero-Martínez, Mario C N Saparrat, Mauricio A Trujillo-Roldán, Norma A Valdez-Cruz. Microb Cell Fact. (2019) 18(1):200. https://doi.org/10.1186/s12934-019-1248-0

Molecular dynamics on laccase from Trametes versicolor to examine thermal stability induced by salt bridges
Leonardo David Herrera-Zúñiga, Cesar Millán-Pacheco, Gustavo Viniegra-González, Elba Villegas. Leticia Arregui, Arturo Rojo-Domínguez. Chemical Physics. (2019) 517:253-264. https://doi.org/10.1016/j.chemphys.2018.10.019

What comparisons of natural and chimeric contacts reveal about inhibition of human cathepsins K, L and S by their prosegments
Juan Carlos Martínez-Hernández, Iris N. Serratos, César Millán-Pacheco, Arturo Rojo-Domínguez, Jaqueline Padilla-Zúñiga. J. Mex. Chem. Soc. (2019) 63(1):13-24. https://doi.org/10.29356/jmcs.v62i4.684

The small organic molecule C19 binds and strengthens the KRAS4b-PDEδ complex and inhibits growth of colorectal cancer cells in vitro and in vivo
Cruz-Nova P, Schnoor M, Correa-Basurto J, Bello M, Briseño-Díaz P, Rojo-Domínguez A, Ortiz-Mendoza CM, Guerrero-Aguirre J, García-Vázquez FJ, Hernández-Rivas R, Thompson-Bonilla MDR, Vargas M. BMC Cancer. (2018) 18(1):1056. https://doi.org/10.1186/s12885-018-4968-3

Prevalence and ancestral origin of the c.1987delC GAA gene mutation causing Pompe disease in Central Mexico
Adriana Grijalva-Pérez, Carmen Esmer, Sandra Romero-Hidalgo, Arturo Rojo-Domínguez, Sandra Rosas-Madrigal, Rafael Velázquez-Cruz, Teresa Villarreal-Molina, Victor Acuña-Alonzo, Antonio Bravo-Oro, Alessandra Carnevale. Meta Gene. (2018) 15: 60-64.https://doi.org/10.1016/j.mgene.2017.11.005

KRas4B-PDE6δ complex stabilization by small molecules obtained by virtual screening affects Ras signaling in pancreatic cancer
Casique-Aguirre D, Briseño-Díaz P, García-Gutiérrez P, la Rosa CHG, Quintero-Barceinas RS, Rojo-Domínguez A, Vergara I, Medina LA, Correa-Basurto J, Bello M, Hernández-Rivas R, Thompson-Bonilla M, Vargas M. BMC Cancer. (2018) Dec 29; 18(1):1299. https://doi.org/10.1186/s12885-018-5142-7

Compound heterozygous KCNQ1 mutations (A300T/P535T) in a child with sudden unexplained death: Insights into possible molecular mechanisms based on protein modeling
Antúnez-Argüelles E, Rojo-Domínguez A, Arregui-Mena AL, Jacobo-Albavera L, Márquez MF, Iturralde-Torres P, Villarreal-Molina MT. Gene. (2017) Sep 5; 627:40-48. https://doi.org/10.1016/j.gene.2017.06.011

A new nucleocytoplasmic RhoGAP protein contributes to control the pathogenicity of Entamoeba histolytica by regulating EhRacC and EhRacD activity
Hernandez-Flores A, Almaraz-Barrera MJ, Lozano-Amado D, Correa-Basurto J, Rojo-Domínguez A, Luna-Rivera E, Schnoor M, Guillen N, Hernandez-Rivas R, Vargas M. Cellular Microbiology. (2016). Nov; 18 (11): 1653-1672https://doi.org/10.1111/cmi.12603

Multinucleation and Polykaryon Formation is Promoted by the EhPC4 Transcription Factor in Entamoeba histolytica
Hernández de la Cruz O, Marchat LA, Guillén N, Weber C, López Rosas I, Díaz-Chávez J, Herrera L, Rojo-Domínguez A, Orozco E, López-Camarillo C. Scientific Reports. Nature. (2016) Jan 21; 6: 19611. https://doi.org/10.1038/srep19611

Memorias de Congreso

Multi-agent systems applied in the modeling and simulation of biological problems: A case study in protein folding
Pedro Pablo González Pérez, Hiram I Beltrán, Arturo Rojo-Domínguez, Máximo Eduardo, Sánchez Gutiérrez. Revista World Academy of Science, Engineering and Technology. Volumen 58 Páginas 128. Fecha de publicación 2009/10/26. doi.org/10.5281/zenodo.1060185
Sitio alternativo de la editorial

Exploring dimensionality, systematic mutations and number of contacts in simple HP ab-initio protein folding using a blackboard-based agent platform
Hiram I Beltrán, Arturo Rojo-Domínguez, Máximo Eduardo Sánchez Gutiérrez, Pedro Pablo, González Pérez. Revista Int J Phys Math Sci.  Volumen 3. Páginas 256-265. Fecha de publicación 2009/4/21. doi.org/10.5281/zenodo.1074373
Sitio alternative de la editorial

Capítulos en Libros

La incorporación de lascompetencias digitales en los modelos educativos, el ejemplo de la UAM-C
Leticia Arregui Mena, Arturo Rojo Domínguez
Prácticas educativas durante la pandemia por Covid-19: innovación docente en la Universidad Autónoma Metropolitana
UAM (2022). En prensa

Comunicación de la ciencia: una puerta abierta a la interdisciplina
Yadira Palacios Rodríguez, Arturo Rojo Domínguez
En Didáctica en acción. Diferentes formas de enseñar en la Universidad
ISBN 978-607-28-1603- 9. UAM (2019) pp 251-260

Los retos de la educación superior en la era digital
Ana Leticia Arregui Mena, Arturo Rojo Domínguez
En Diálogos. La formación universitaria en la era digital
ISBN 978-607-28-1233-8. UAM (2017). pp 59-82

Biodiversidad
Leticia Arregui Mena y Arturo Rojo-Domínguez
Capítulo 6 del libro de texto: Sustentabilidad. Una visión interdisciplinaria..
ISBN 978-607-28-0807-2. UAM (2016). pp 87-102


El uso de herramientas digitales en bioinformática
Arturo Rojo-Domínguez
Capítulo 4 del libro: Innovación educativa y apropiación tecnológica: experiencias docentes con el uso de las TIC
ISBN 978-607-28-0603-0. UAM (2015). pp 71-84

El origen de las especies y la evolución molecular
Arturo Rojo-Domínguez
Contribución sobre el concepto de evolución en el desarrollo contemporáneo de las ciencias y la tecnología
Textos explicativos en El origen de las especies, Facsímil de la primera edición en español, 1877. ISBN 978-607-28-0606-1. UAM (2015). pp XXXIII-XXXVII

Un curso en modalidad semipresencial para acreditar Introducción al pensamiento matemático
Arturo Rojo-Domínguez
Capítulo del libro: Diálogos: Las TIC en la Universidad
ISBN 978-607-9011-43-7. UAM (2015). pp 129-134

Docking as a tool for protein-ligand analysis: discovery and design of ligands inhibitors and drugs
Arturo Rojo-Domínguez
Capítulo 9 del libro: Current Topics of Drug Design in Parasitic and Bacterial Diseases
ISBN 978-81-7895-553-7. Transworld Research Network. Kerala, India. (2012). pp 159-176

Glycoconjugates: Advantages of conjugation analyzed fragment to fragment and determination of physicochemical properties useful for wide applications
Hiram I. Beltrán, José Campos-Terán, Felipe Aparicio, Arturo Rojo-Domínguez
Capítulo 8 del libro: Molecular Systems: Theory and Modeling ISBN 978-81-7895-391-5. Transworld Research Network. Kerala, India. (2011). pp 169-230

Bioinformática
Arturo Rojo Domínguez
Capítulo 9 del libro: Introducción a la Física Biológica. Tomo I
ISBN 978-607-7630-77-7. El Colegio Nacional. México. (2010). pp 317-371

Production of extracellular thermostable protease by Yarrowia lipolytica in solid state fermentation
Hernández-Martínez R., Loera-Corral O., Rojo-Domínguez A., Regalado C., Huerta-Ochoa S., Prado-Barragán L.A.
Capítulo 10 del libro: Innovations in Food Science and Food Biotechnology in Developing Countries
ISBN 978-607-95455-0-5. Publicado por la Asociación Mexicana de Ciencia de los Alimentos, A.C. (2010). pp 139-147
http://amecamex.mx/

Biofisicoquímica
Arturo Rojo-Domínguez
COSMOS. Enciclopedia de las Ciencias en México. Tomo Química
ISBN 978-607-477-137-4.UAM (2010). pp 146-157

Computational analysis on protein structures
Arturo Rojo-Domínguez
Capítulo 4 del libro: Advances in Protein Physical Chemistry
Research Signpost. Kerala, India. (2007). pp 51-69

Bases moleculares del reconocimiento proteína-carbohidrato
A. Chavelas, Nancy O. Pulido, Martiniano Bello, Arturo Rojo-Domínguez y Enrique García-Hernández
En: Física Biológica en México: Temas Selectos. Editado por el Colegio Nacional. (2006). pp 255-278

Computer analysis of protein properties
Arturo Rojo-Domínguez y Jaqueline Padilla-Zúñiga
En: Functional Properties of Proteins and Lipids. (John Whitaker, editor)
ISBN 0-8412-3584-8. American Chemical Society, Symposium Series Number 708 (1998)
http://www.amazon.com/Functional-Properties-Proteins-Lipids-Symposium/dp/0841235848/ref=sr_11_1?ie=UTF8&qid=1202249933&sr=11-1

Simulación del reconocimiento entre proteínas y moléculas orgánicas o docking. Aplicación al diseño de fármacos
Jaqueline Padilla Zúñiga, Arturo Rojo Domínguez
En: Mensaje Bioquímico. Volumen 26. pp 129-145. Fecha de publicación 2002

Libros

Formación de Recursos Humanos

Profesor de la Universidad Autónoma Metropolitana desde 1984. Ha impartido más de 300 cursos de licenciatura y posgrado en la UAM. También ha sido invitado a impartir cursos en otras universidades y centros de investigación.

A la fecha cuenta con la dirección concluida de 12 proyectos terminales de estudiantes de licenciatura, 1 tesis de especialidad, 6 tesis a nivel maestría, 9 de nivel doctorado y cuatro posdoctorados.

Otra Información de Relevancia Académica